Στο Τμήμα μας λειτουργεί από το ακαδημαϊκό έτος 1998-1999 διατμηματικό μεταπτυχιακό πρόγραμμα στις Βυζαντινές Σπουδές (ΦΕΚ 848/12-8-98). Το πρόγραμμα αυτό οργανώθηκε αρχικά από τα Τμήματα Ιστορίας και Αρχαιολογίας, Φιλολογίας και Φυσικής του Πανεπιστημίου Κρήτης και με τη συνεργασία του Πολυτεχνείου Κρήτης.
Με τη νέα υπουργική απόφαση (ΦΕΚ 1400/2-6-2014), που εκδόθηκε στις 2 Ιουνίου του 2014, το πρόγραμμα μεταπτυχιακών σπουδών στις Βυζαντινές Σπουδές, στο εξής πρόγραμμα μεταπτυχιακών σπουδών στις Βυζαντινές και Μεσαιωνικές Σπουδές, αναμορφώθηκε και λειτουργεί πλέον ως μονοτμηματικό.
Το πρόγραμμα αρχικά είχε τρεις κατευθύνσεις, μέχρι και το ακαδημαϊκό έτος 2009-10, οι οποίες αποτελούσαν και επιμέρους τομείς ειδίκευσης και οδηγούσε στην απονομή Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ειδίκευσης καθώς και Διδακτορικού Διπλώματος (έως και το 2009, οπότε θεσμοθετήθηκε το Πρόγραμμα Διδακτορικών Σπουδών του Τμήματος) στη:
α) Βυζαντινή Ιστορία
β) Βυζαντινή Αρχαιολογία και Ιστορία της Βυζαντινής Τέχνης.
γ) Βυζαντινή Φιλολογία (η κατεύθυνση αυτή καταργήθηκε από το ακαδημαϊκό έτος 2010-11).
Μεταξύ των ακαδημαϊκών ετών 2010-11 και 2012-13 το πρόγραμμα λειτούργησε με δύο κατευθύνσεις (την α και τη β).
Από το ακαδημαϊκό έτος 2013-14 το πρόγραμμα διαθέτει και πάλι τρεις κατευθύνσεις ως εξής:
α) Βυζαντινή Ιστορία
β) Μεσαιωνική Ιστορία της Δύσης
γ) Βυζαντινή Αρχαιολογία και Ιστορία της Βυζαντινής Τέχνης
- Προκήρυξη εξετάσεων εισαγωγής στο ΠΜΣ «Βυζαντινές και Μεσαιωνικές Σπουδές» – 17-18/2/16
- Ύλη εξετάσεων εισαγωγής στο Π.Μ.Σ. “Βυζαντινές και Μεσαιωνικές Σπουδές”
- Νέα Υπουργική Απόφαση για το ΠΜΣ στις Βυζαντινές και Μεσαιωνικές Σπουδές (ΦΕΚ 1400/2-6-2014)
- Εσωτερικός κανονισμός λειτουργίας
- Παλιός κανονισμός σπουδών (ισχύει για εισαχθέντες έως και το ακαδημαϊκό έτος 2013-2014)
- Προσφερόμενα μαθήματα ακαδημαϊκού έτους 2008-2009
- Μεταπτυχιακά διπλώματα ειδίκευσης στις Βυζαντινές Σπουδές
- Διδάκτορες Βυζαντινών Σπουδών
